古典トラジェクトリー計算
古典トラジェクトリー計算は吸脱着や反応性衝突のダイナミクスを解析するのにしばしば用いられる手法であるが、このアプローチが生体反応に関しても有用であることは論を待たない。本研究室ではこれに基づき、生体反応のフェムト秒 (10–15 s) 単位での挙動を明らかにする試みを行っている。各原子の運動については Born-Oppenheimer 近似を仮定し、Velocity Verlet アルゴリズムにより決定することができる。0.5 fs 毎に各原子にかかる力を量子化学計算により解析的に求めるとで、従来に比べ極めて精度の高い検討を可能にしている。
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| 古典トラジェクトリー計算の概要 |
